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计算生物学 · 药物发现
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我的研究
当前进度与计划
已完成
- [x] MiMeDB 数据库下载与清洗(24409 → 24122 → 11576)
- [x] 配体制备与高通量对接(11421 个分子对接成功)
- [x] 对接后相互作用分析(PLIP)
- [x] 多指标打分排序
- [x] Gnina 重评分与重对接
- [x] 核心交集 → 57 个候选分子
- [x] 供应商可购性确认
- [x] 购买代谢物库
进行中
- [x] SW480-FTH-IRE-WT 细胞初筛→13 个阳性化合物
- [x] SW480-FTH-IRE-WT 复筛→重复出10个阳性化合物
实验验证计划
- IRE-Luc 报告系统初筛 — 3 种SW480 稳转细胞系
- 铁稳态标志蛋白验证 — Western blot 检测 FTH1/FTH2/ TfR1 / IRP2/IRP1
- IRP2–IRE 结合直证 — Biotin-RNA pull-down
- IRP2 依赖性验证 — siRNA 敲低
- 氧化应激与铁水平检测 — ROS / FerroOrange
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