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计算生物学 · 药物发现
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申博方向与课题组推荐 — 大学篇
个人背景：211 本（华中农业大学），硕士课题为"基于虚拟筛选鉴定调控 IRPs-IREs 铁稳态调控系统的肠道微生物代谢物" 目标方向：AI 药物辅助筛选 → 靶点验证 → 药物制剂研发（全链条） 偏好策略：路径 B — 主导师做 AI 筛选+验证，副导师/合作导师做制剂 目标层级：中上游 985 + 科研院所 | 排除大西北和东北地区 | 2026 年更新
目录
- 武汉大学
- 华中科技大学
- 中南大学
- 四川大学
- 电子科技大学
- 中山大学
- 厦门大学
- 南开大学
- 山东大学
- 华东理工大学（211，药学极强）
- 重庆大学
- 中国药科大学（211，药学顶尖）
- 湖南大学
- 华南理工大学
- 西安交通大学
- 西北工业大学
- 其他可关注院校
- 制剂方向副导师速查
1. 武汉大学
刘娟 教授
- 学院：计算机学院 / 人工智能研究院
- 职务：二级教授、博导、人工智能研究院副院长
- 方向：生物医学人工智能、药物虚拟筛选、药物分子智能设计、病理图像分析
- 亮点：吴文俊人工智能科学技术自然科学二等奖
- 实验室：https://biod.whu.edu.cn/
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐
- 备注：AI+药物筛选算法方向，计算为主
林映甫 教授
- 学院：药学院
- 入职：2023 年（青年引进）
- 方向：数据科学赋能的药物分子设计、AI + 高通量实验（HTE）+ 自动化 + 机器学习辅助药物研发
- 亮点：在 Science 发表计算机辅助天然产物全合成论文
- 背景：美国密歇根大学博士后，师从 Tim Cernak
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐
- 备注：干湿结合极佳，药物化学+计算交叉
董长江 教授
- 学院：药学院
- 方向：AI 辅助抗感染药物设计、微生物结构生物学、冷冻电镜
- 背景：英国东英吉利亚大学分子医学教授（2012–2021）
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
- 备注：结构生物学+AI 药物设计，平台好
周海兵 教授
- 学院：药学院
- 方向：药物化学、抗肿瘤药物设计与优化、共价抑制剂
- 契合度：⭐⭐⭐
- 备注：偏药化方向，可作为制剂/药物化学方面的副导师
2. 华中科技大学
李华 教授
- 学院：同济医学院药学院
- 职务：生物药学系主任、博导
- 方向：结构药理学、计算机虚拟筛选、基于结构的药物设计、PROTAC
- 教育背景：沈阳药科大学本科，布朗大学博士（分子生物学/生物化学）
- 亮点：新冠虚拟筛选研究获 Nature 关注，论文 100+ 篇（Science 等）
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐
- 备注：武汉本地，干湿结合，同济医学院资源丰富
刘俊军 教授
- 学院：药学院
- 方向：药物化学
- 契合度：⭐⭐⭐
- 备注：需进一步了解具体课题方向
3. 中南大学（长沙）
曹东升 教授 ⭐ 强烈推荐
- 学院：湘雅药学院
- 职务：副院长、博导、人工智能药学交叉研究中心主任
- 头衔：国家重点研发计划首席科学家、国家万人计划青年拔尖人才、全球前 2% 顶尖科学家
- 方向：人工智能药物设计、药物靶标预测（TargetNet）、虚拟筛选、ADMET 预测（ADMETlab）、分子动力学模拟
- 成果：SCI 290+ 篇，H-index 64，开发软件平台 39 套（被 Pfizer、Merck、哈佛等使用）
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐
- 备注：湘雅品牌+AI 药学交叉中心，团队大，资源多
李乾斌 教授
- 学院：湘雅药学院
- 职务：副院长、博导
- 方向：计算机辅助药物设计（CADD）、基于靶标的药物设计与虚拟筛选
- 背景：美国弗吉尼亚联邦大学博士后
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
- 备注：CADD+药物化学结合
刘韶 教授
- 学院：湘雅医院
- 职务：药学部主任、中南大学 AI 药学交叉研究中心副主任
- 方向：AI 药学、临床药学
- 契合度：⭐⭐⭐
- 备注：临床转化方向，可作为制剂/临床转化副导师
4. 四川大学（成都）
杨胜勇 教授 ⭐ 强烈推荐
- 学院：华西药学院
- 头衔：长江学者、国家杰青、新基石研究员
- 方向：AI 驱动的创新药物研发、分子生成模型（CapsNet、GDL_cRNN 等）、小分子靶向药物发现
- 亮点：Science、Nat Med 发文；5 个一类新药进入 I–III 期临床；国家自然科学二等奖
- 地位：国内 AI 药物设计领域领军人物之一
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐
李国菠 教授
- 学院：华西药学院
- 头衔：国家级青年人才
- 方向：AI+药物化学、靶向金属酶药物分子设计
- 成果：Nucleic Acids Res、J Med Chem 等 50+ 篇
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
刘祥根 副研究员/博导
- 学院：计算机学院
- 方向：深度学习、AI 药物设计、分子生成模型、扩散模型
- 亮点：Nature Communications 发文，每年招 2 名博士生
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
- 备注：偏计算算法
曹阳 教授
- 学院：生命科学学院
- 方向：计算机辅助药物设计（CADD）、蛋白质设计、虚拟筛选
- 亮点：开发 CB-Dock2 蛋白-配体盲对接方法
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
蒲雪梅 教授
- 学院：化学学院
- 方向：计算机辅助药物设计、机器学习+计算模拟
- 契合度：⭐⭐⭐
林涛 教授
- 学院：计算机学院
- 方向：AI、药物相互作用预测（图神经网络）
- 成果：Nature Communications、IEEE TPAMI 等 100+ 篇
- 契合度：⭐⭐⭐
何勤 教授 🔥 制剂方向
- 学院：华西药学院
- 职务：副院长、二级教授、博导
- 方向：新型药物靶向递药系统、纳米制剂、肿瘤靶向递送
- 头衔：国务院特贴专家、Elsevier 高被引学者、全球前 2% 科学家
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐（作为副导师/制剂方向合作者）
孙逊 教授 🔥 制剂方向
- 学院：华西药学院/药剂学系主任
- 头衔：国家杰青、国家药典委员
- 方向：疫苗和核酸递送系统、药物靶向传递
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐（作为副导师/制剂方向合作者）
川大是你 B 层级最强选择之一。杨胜勇（筛选+验证）+ 何勤/孙逊（制剂），同一个校园内，完美匹配路径 B。
5. 电子科技大学（成都）
师健友 研究员/博导
- 学院：医学院 / 四川省人民医院
- 方向：计算辅助药物设计、小分子药物机理、天然产物结构优化
- 成果：Signal Transduction and Targeted Therapy、J Med Chem 等 42 篇
- 契合度：⭐⭐⭐
6. 中山大学（广州）
罗海彬 教授 ⭐ 强烈推荐
- 学院：药学院
- 职务：副院长、博导
- 头衔：广东省"珠江学者"特聘教授、国家优青、国家重点研发计划首席科学家
- 方向：AI 药物设计与虚拟筛选、自由能微扰（FEP）方法学、肺部炎症药物
- 亮点：
- 新冠虚拟筛选入围 戈登贝尔奖特别奖（中国首次）
- 开发 GA-FEP 方法，效率提高 30–60 倍
- PNAS、J Med Chem 等顶刊发文
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐
- 备注：依托天河超算，计算资源顶级
杨跃东 教授
- 学院：计算机学院
- 职务：国家超算广州中心总工程师、国家青年人才
- 方向：智能药物设计、生物大分子结构与功能预测、多模态组学大数据
- 成果：引用 >10,000，H-index >50
- 实验室：http://biomed.nscc-gz.cn/sail/
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
- 备注：超算资源丰富，AI 算法强
7. 厦门大学
纪志梁 教授
- 学院：生命科学学院
- 方向：AI 药物毒理学、系统计算药物毒理学、生物医药大数据
- 课题组：http://www.bio-add.org/
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
- 备注：药物毒理学方向独特
闵小平 副教授
- 学院：医学与生命科学学部
- 方向：AI 蛋白质设计、小分子药物设计、结合位点预测
- 契合度：⭐⭐⭐
姚蓝田 助理教授
- 学院：信息学院
- 方向：AI 驱动的智能药物设计、多组学数据分析
- 备注：新入职，正在招生，不限背景
- 契合度：⭐⭐⭐
8. 南开大学（天津）
林建平 教授
- 学院：药学院
- 方向：AI/计算机辅助药物设计、生物大分子模拟、虚拟筛选平台
- 成果：开发 YaTCM、GCDB、ADMETNet 等药物研发平台
- 亮点：与天士力合作 AI 中药筛选
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
- 备注：天津区位，有药企合作
刘健 教授
- 学院：计算机学院
- 方向：AI+BT、生物医药大数据、肿瘤多组学
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
9. 山东大学（济南/青岛）
杨锦飞 研究员
- 学院：药学院
- 头衔：泰山学者青年专家
- 方向：AI 驱动靶向药物设计、药物化学交叉
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
10. 华东理工大学（211，药学极强，上海）
唐赟 教授 ⭐ 强烈推荐
- 学院：药学院
- 职务：二级教授、上海市新药设计重点实验室主任
- 方向：AI 药物设计、计算毒理学、化学信息学、虚拟筛选方法开发
- 成果：SCI 300+ 篇（含 ESI 高被引 4 篇），软件著作权 30+ 项
- 亮点：药明康德生命化学研究奖（2022）
- 实验室：https://lmmd.ecust.edu.cn/
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐
- 备注：虽是 211，但药学实力超过很多 985，在上海区位好
11. 重庆大学
- 药学院有药物设计方向导师，但整体实力相对于上述院校偏弱
- 可关注其 药学院 和 生物工程学院 的导师信息
- 建议后续重点查询具体导师
12. 中国药科大学（211，药学顶尖，南京）
张亮 教授
- 头衔：兴药领军学者
- 方向：AI 赋能药物研发
- 背景：计算机博士，曾任职百度硅谷研究院深度学习实验室
- 亮点：mRNA 序列设计算法 LinearDesign 发表于 Nature 正刊
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐
费宇涵 教授
- 学院：药学院
- 入职：2025 年 12 月（兴药领军学者）
- 方向：AI+生物医药、RNA 靶向小分子药物、mRNA 疫苗优化、AI 虚拟细胞
- 成果：Nature Biotechnology（2026）、Nature Methods（2022）
- 契合度：⭐⭐⭐⭐⭐
- 备注：新入职正在组建团队，机会多
陈钦畅 特聘研究员
- 学院：生物药物学院
- 入职：2025 年（兴药青创学者）
- 方向：AI+分子模拟驱动的药物发现、蛋白质挖掘与优化设计
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
韩进松 教授
- 学院：工学院
- 方向：机器学习+计算机辅助药物设计、抗肿瘤药物
- 头衔：国家海外高层次人才引进计划
- 契合度：⭐⭐⭐⭐
邹建军 主任药师/博导
- 单位：南京市第一医院（中国药科大学研究生导师）
- 方向：AI+药代动力学、TDM 精准给药、临床药动学 AI 建模
- 契合度：⭐⭐⭐⭐（药代方向桥梁）
中国药科大学在药学领域是绝对顶尖（药学 A+），虽是 211 但药学声誉超过绝大多数 985，且南京区位极佳。
13. 湖南大学（长沙）
- 化学化工学院有药物设计方向导师（如分子模拟、计算化学）
- 生物学院涉及纳米药物方向
- 建议后续具体查询
14. 华南理工大学（广州）
- 生物科学与工程学院、医学院有相关方向
- AI 药物筛选方面不如中山大学集中
- 建议后续具体查询
15. 西安交通大学
- 药学院有药物筛选与靶点验证课题组
- 生命学院有生物信息学方向
- 西安虽属西北但非"大西北"，资源丰富
- 建议后续具体查询
16. 西北工业大学（西安）
- 生命学院有药物筛选、分子模拟方向
- 计算机学院有 AI for Science 方向
- 建议后续具体查询
17. 其他可关注院校
| 院校 | 地区 | 可关注方向 | 备注 |
|---|---|---|---|
| 郑州大学 | 郑州 | 药物化学、药理学 | 211，省部共建 |
| 南昌大学 | 南昌 | 药学、食品科学 | 211 |
| 云南大学 | 昆明 | 天然产物化学 | 211/双一流 |
| 上海科技大学 | 上海 | AI 药物设计、结构生物学 | 双一流，实力强于很多 985 |
| 南方科技大学 | 深圳 | 化学生物学、计算生物学 | 双一流 |
| 南京医科大学 | 南京 | 药理学 | 双一流 |
18. 制剂方向副导师速查
适合路径 B（主+副双导师策略）的制剂方向副导师：
| 院校 | 制剂方向 PI | 头衔 | 契合度 |
|---|---|---|---|
| 四川大学华西药学院 | 何勤 教授 | 副院长、二级教授、国务院特贴 | ⭐⭐⭐⭐⭐ |
| 四川大学华西药学院 | 孙逊 教授 | 药剂系主任、国家杰青 | ⭐⭐⭐⭐⭐ |
| 华中科技大学 | 可跨院系合作制剂方向 | — | ⭐⭐⭐ |
| 中南大学湘雅医院 | 刘韶 主任 | AI 药学交叉中心副主任 | ⭐⭐⭐ |
| 中山大学 | 药学院另有制剂课题组 | — | 需查询 |
| 武汉大学 | 药学院有药剂学方向 | — | 需查询 |
优先推荐排名（综合契合度+录取概率）
| 排名 | 院校 | 主导师 | 副导师（制剂） | 推荐理由 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 四川大学 | 杨胜勇 | 何勤/孙逊 | 同一校园内的完美双导师组合 |
| 2 | 中南大学 | 曹东升 | 刘韶（AI 药学） | 湘雅品牌，交叉中心资源好 |
| 3 | 中山大学 | 罗海彬 | — | 超算资源，虚拟筛选极强 |
| 4 | 武汉大学 | 林映甫/刘娟 | 可搭配 | 离家近，有药学院基础 |
| 5 | 华东理工大学 | 唐赟 | 可搭配 | 上海区位，计算+实验结合 |
| 6 | 华中科技大学 | 李华 | 可搭配 | 武汉本地，同济品牌 |
| 7 | 中国药科大学 | 张亮/费宇涵 | — | 药学A+顶尖，南京区位 |
| 8 | 南开大学 | 林建平 | — | 药企合作经验丰富 |
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